Câu chuyện trong bộ anime Học Viện Siêu Anh Hùng Phần 4, Boku no Hero Academia 4th Season kể về những sự kiện mới, đó chính là sau khi vượt qua thành công kỳ thi Giấy phép Anh hùng Tạm thời, thì giờ đây cũng là lúc mà Izuku “Deku” Midoriya tìm kiếm một khóa thực tập ngoại khóa với một công ty anh hùng chuyên nghiệp, và đó cũng chính là con đường mà anh phải đi qua để trở thành một anh hùng chuyên nghiệp. Theo lời giới thiệu của người cố vấn All Might, Midoriya nhận được một vị trí dưới quyền của người cộng sự cũ của All Might, Sir Nighteye, hiện là một anh hùng nổi tiếng theo đúng nghĩa của anh ta.
Khi các bạn cùng lớp của Midoriya nâng cao khả năng của bản thân thông qua nhiều đợt thực tập khác nhau, nhân vật phản diện mới nổi Kai Chisaki sử dụng sức mạnh đáng sợ của mình để thu hút sự ủng hộ trong thế giới ngầm tội phạm. Được biết đến với biệt danh Đại tu, tham vọng của Chisaki xung đột với Liên minh tội phạm và thủ lĩnh của nó, Tomura Shigaraki. Thông qua công việc của mình với Sir Nighteye, Midoriya phát hiện ra tổ chức tội phạm của Chisaki và mối quan hệ thù địch của kẻ thủ ác với một cô gái trẻ bí ẩn tên là Eri. Lo sợ cho sự an toàn của đứa trẻ, Midoriya và đàn chị Mirio Toogata phải hợp tác với nhau để chấm dứt triều đại khủng bố của Chisaki.